17/09/2023
Chuyên đề " Mỗi tuần một khái niệm"
Con số Ct, Cq trong xét nghiệm bằng phương pháp Real Time PCR (qRT PCR ) là gì???
Khác với phương pháp RT PCR (Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction), với Real Time PCR (qRT PCR - Real-Time Quantitative Reverse Transcription) sau khi ra kết quả ÂM TÍNH hay DƯƠNG TÍNH thường sẽ kèm theo 1 con số Ct (Cycle threshold) hay Cq ( Cycle quantification). Nó là gì????
Hãy tưởng tượng rằng bạn đang chạy theo vòng tròn trên 1 sân bóng, trên đường chạy đó người ta để 1 viên bi, nhiệm vụ của các bạn là vừa chạy và vừa tìm ra viên bi đó, sau 1 vòng bạn không tìm được, sau 2,3,4 vòng sân cũng không được, đến vòng thứ 5 thì bạn tìm được viên bi. Lúc đó có thể gọi Ct hay Cq=5. Tương tự, nếu mình để trên đường tròn đó 100 viên bi giống nhau, chỉ cần bạn chạy 1,2 vòng là tìm được viên bi đó, lúc đó kết luận Ct hay Cq=1 ( chạy 1 vòng tìm thấy viên bi). Như vậy, mình có thể hiểu nôm na giá trị của Ct hay Cq chính là “ Số vòng quay (hay số chu kỳ) mà máy chạy PCR cần chạy để tìm ra được đối tượng cần tìm trong mẫu chạy”
Như vậy, chỉ số Ct hay Cq CÀNG NHỎ thì chứng tỏ trong mẫu mình cần chạy đang có RẤT NHIỀU đối tượng mình cần tìm (Vì chỉ cần máy chạy một vài vòng là đã tìm ra đối tượng ) và ngược lại, khi Ct hay Cq CÀNG LỚN thì chứng tỏ trong mẫu của mình có RẤT ÍT đối tượng, thậm chí là không có.
Điểm cắt (Cutoff Value) trong PCR là gì?
Có thể hiểu điểm Cutoff trong PCR là điểm để phân biệt ranh giới giữa ÂM TÍNH và DƯƠNG TÍNH trong kỹ thuật chạy PCR. Ví dụ :
Khi bạn chạy qRT PCR về AI ( Cúm gia cầm), sau khi ra kết quả là dương tính và có chỉ số Ct = 32, lúc này , khi bạn hỏi về phòng Lab hay Kỹ thuật viên chạy PCR thì họ báo cho bạn biết trong phương pháp này thì điểm Cutoff là bao nhiêu? ví dụ trong trường hợp này thì điểm Cutoff= 35 (Nó sẽ tuỳ vào phương pháp cũng như tuỳ vào phòng Lab). Nghĩa là chạy ra có Ct35 sẽ là ÂM TÍNH (Lý thuyết là như vậy).
Vậy, nếu kết quả bạn chạy ra ví dụ có Ct = 34,5 hay Ct = 35,5 thì bạn sẽ kết luận điều gì trong trường hợp trên??????
Nếu được, các bạn có thể chia sẽ quan điểm dưới Comments nhé, không phân biệt đúng sai, chỉ cùng nhau góp ý để giúp nhau cùng phát triển hơn
“ Mình không cần phải hơn người khác
Mình chỉ cần tốt hơn mình của ngày hôm qua là đủ rồi “
(Sưu tầm)